菏泽卫生学校办学特色鲜明，专业优势突出，开设了面向山东省生源的“3+2”本科贯通分段培养康复治疗技术专业，以及护理、助产、口腔医学、针灸推拿、医学影像技术、口腔医学技术、康复治疗技术、中医康复技术、社区康复、医学检验技术、药学、药品经营与管理、家政服务与管理、老年服务与管理、酒店管理、汽车运用与维修技术、会计、早期教育、空中乘务、高速铁路客运乘务20个大专专业，10个中专专业。老年服务与管理专业为国家级养老示范专业。护理专业、家政服务专业为中央财政支持的重点专业建设项目，家政服务专业、康复治疗技术专业为省级特色专业。